遠在災難總部建立、林間空地建成、托馬斯進入迷宮之前,地球就遭到了太陽耀斑的襲擊,疾病肆虐,吞噬著人類。 生活在紐約的少年馬克目睹成千上萬的生命被太陽耀斑奪去,緊接著又遭遇了洪水、食物短缺和令人窒息的滾滾熱浪。馬克和女友翠娜在退役軍人亞歷克的幫助下,帶領一群幸存者輾轉遷徙到遠離海洋的阿巴拉契亞山脈地帶。但是好景不長,一艘神秘飛船帶來致命病毒在人群中急劇擴散、肆意傳播。 馬克一行跋山涉水,冒著生命危險尋求飛船的來由和疾病產生的原因。他們遇見一個名叫迪迪的小女孩,奇怪的是迪迪在被帶有病毒的飛鏢射中後卻沒有感染。馬克他們決定保護迪迪,把她送到一個安全的地方,希望有人能夠借此研究出針對病毒的解藥,他們能成功嗎?